Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
GAPVD1Q14C86 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
GAPVD1Q14C86 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
GAPVD1Q14C86 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
GAPVD1Q14C86 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
GAPVD1Q14C86 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
GAPVD1Q14C86 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
GAPVD1Q14C86 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
GAPVD1Q14C86 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
GAPVD1Q14C86 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
GAPVD1Q14C86 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.54
GAPVD1Q14C86 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
GAPVD1Q14C86 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
GAPVD1Q14C86 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
GAPVD1Q14C86 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
GAPVD1Q14C86 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
GAPVD1Q14C86 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
GAPVD1Q14C86 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
GAPVD1Q14C86 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
GAPVD1Q14C86 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
GAPVD1Q14C86 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
GAPVD1Q14C86 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
GAPVD1Q14C86 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
GAPVD1Q14C86 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
GAPVD1Q14C86 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
GAPVD1Q14C86 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
GAPVD1Q14C86 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
GAPVD1Q14C86 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
GAPVD1Q14C86 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
GAPVD1Q14C86 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
GAPVD1Q14C86 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
GAPVD1Q14C86 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC37.11■■■■□ 3.53
GAPVD1Q14C86 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
GAPVD1Q14C86 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
GAPVD1Q14C86 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
GAPVD1Q14C86 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
GAPVD1Q14C86 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
GAPVD1Q14C86 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
GAPVD1Q14C86 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
GAPVD1Q14C86 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
GAPVD1Q14C86 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
GAPVD1Q14C86 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
GAPVD1Q14C86 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
GAPVD1Q14C86 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
GAPVD1Q14C86 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
GAPVD1Q14C86 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
GAPVD1Q14C86 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
GAPVD1Q14C86 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC37.09■■■■□ 3.53
GAPVD1Q14C86 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
GAPVD1Q14C86 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
GAPVD1Q14C86 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
GAPVD1Q14C86 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
GAPVD1Q14C86 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
GAPVD1Q14C86 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
GAPVD1Q14C86 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
GAPVD1Q14C86 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.53
GAPVD1Q14C86 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
GAPVD1Q14C86 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
GAPVD1Q14C86 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
GAPVD1Q14C86 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
GAPVD1Q14C86 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
GAPVD1Q14C86 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
GAPVD1Q14C86 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
GAPVD1Q14C86 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
GAPVD1Q14C86 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
GAPVD1Q14C86 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
GAPVD1Q14C86 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
GAPVD1Q14C86 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
GAPVD1Q14C86 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
GAPVD1Q14C86 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
GAPVD1Q14C86 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
GAPVD1Q14C86 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
GAPVD1Q14C86 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
GAPVD1Q14C86 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
GAPVD1Q14C86 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
GAPVD1Q14C86 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
GAPVD1Q14C86 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
GAPVD1Q14C86 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
GAPVD1Q14C86 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
GAPVD1Q14C86 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC37.04■■■■□ 3.52
GAPVD1Q14C86 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
GAPVD1Q14C86 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
GAPVD1Q14C86 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
GAPVD1Q14C86 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
GAPVD1Q14C86 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
GAPVD1Q14C86 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
GAPVD1Q14C86 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
GAPVD1Q14C86 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
GAPVD1Q14C86 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC37.02■■■■□ 3.52
GAPVD1Q14C86 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
GAPVD1Q14C86 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
GAPVD1Q14C86 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
GAPVD1Q14C86 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
GAPVD1Q14C86 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
GAPVD1Q14C86 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
GAPVD1Q14C86 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
GAPVD1Q14C86 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
GAPVD1Q14C86 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
GAPVD1Q14C86 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.51
GAPVD1Q14C86 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC37.01■■■■□ 3.51
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