Protein–RNA interactions for Protein: Q14978

NOLC1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOLC1Q14978 DHCR7-207ENST00000527452 579 ntTSL 415.74■□□□□ 0.114e-9■■■□□ 15.7
NOLC1Q14978 CTSB-233ENST00000534636 633 ntTSL 420.21■□□□□ 0.839e-21■■■□□ 15.7
NOLC1Q14978 CTSB-229ENST00000533572 975 ntTSL 318.73■□□□□ 0.599e-21■■■□□ 15.7
NOLC1Q14978 CTSB-217ENST00000530296 561 ntTSL 415.38■□□□□ 0.059e-21■■■□□ 15.7
NOLC1Q14978 EIF4A1-228ENST00000583389 951 ntTSL 315.94■□□□□ 0.143e-6■■■□□ 15.7
NOLC1Q14978 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.23e-6■■■□□ 15.7
NOLC1Q14978 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.123e-6■■■□□ 15.7
NOLC1Q14978 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.033e-6■■■□□ 15.7
NOLC1Q14978 IFITM3-203ENST00000531688 500 ntTSL 311.24□□□□□ -0.613e-6■■■□□ 15.7
NOLC1Q14978 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.582e-72■■■□□ 15.7
NOLC1Q14978 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.422e-72■■■□□ 15.7
NOLC1Q14978 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.092e-72■■■□□ 15.7
NOLC1Q14978 SNHG17-202ENST00000414142 2102 ntTSL 215.53■□□□□ 0.082e-72■■■□□ 15.7
NOLC1Q14978 SNHG17-204ENST00000423536 517 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.992e-72■■■□□ 15.7
NOLC1Q14978 ARFGAP1-205ENST00000468975 2640 ntTSL 220.61■□□□□ 0.893e-7■■■□□ 15.7
NOLC1Q14978 ARFGAP1-204ENST00000395285 2697 ntTSL 219.79■□□□□ 0.763e-7■■■□□ 15.7
NOLC1Q14978 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.663e-7■■■□□ 15.7
NOLC1Q14978 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.493e-7■■■□□ 15.7
NOLC1Q14978 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.373e-7■■■□□ 15.7
NOLC1Q14978 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.333e-7■■■□□ 15.7
NOLC1Q14978 ALB-204ENST00000441319 591 ntTSL 47.37□□□□□ -1.231e-323■■■□□ 15.7
NOLC1Q14978 LARS-207ENST00000506231 3707 ntTSL 26.26□□□□□ -1.411e-11■■■□□ 15.7
NOLC1Q14978 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.13■■□□□ 1.131e-7■■■□□ 15.7
NOLC1Q14978 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.561e-7■■■□□ 15.7
NOLC1Q14978 HLA-B-257ENST00000640094 147 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91e-7■■■□□ 15.7
NOLC1Q14978 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.161e-6■■■□□ 15.7
NOLC1Q14978 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.33e-6■■■□□ 15.6
NOLC1Q14978 CCNL2-213ENST00000481223 2815 ntTSL 221.93■■□□□ 1.11e-16■■■□□ 15.6
NOLC1Q14978 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.041e-16■■■□□ 15.6
NOLC1Q14978 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.71e-16■■■□□ 15.6
NOLC1Q14978 MELTF-AS1-201ENST00000414354 468 ntTSL 218.14■□□□□ 0.493e-6■■■□□ 15.6
NOLC1Q14978 CCNL2-215ENST00000482621 2059 ntTSL 217.65■□□□□ 0.421e-16■■■□□ 15.6
NOLC1Q14978 CCNL2-206ENST00000463260 1941 ntTSL 1 (best)16.85■□□□□ 0.291e-16■■■□□ 15.6
NOLC1Q14978 CCNL2-218ENST00000496007 4452 ntTSL 216.11■□□□□ 0.171e-16■■■□□ 15.6
NOLC1Q14978 CCNL2-214ENST00000482365 2620 ntTSL 215.74■□□□□ 0.111e-16■■■□□ 15.6
NOLC1Q14978 CCNL2-211ENST00000480479 2792 ntTSL 214.69□□□□□ -0.061e-16■■■□□ 15.6
NOLC1Q14978 CCNL2-204ENST00000418865 3082 ntTSL 1 (best)12.84□□□□□ -0.351e-16■■■□□ 15.6
NOLC1Q14978 MELTF-AS1-203ENST00000424769 356 ntTSL 29.32□□□□□ -0.923e-6■■■□□ 15.6
NOLC1Q14978 MELTF-AS1-204ENST00000437064 306 ntTSL 35.68□□□□□ -1.53e-6■■■□□ 15.6
NOLC1Q14978 PGK1-201ENST00000373316 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.476e-21■■■□□ 15.6
NOLC1Q14978 PGK1-203ENST00000476531 960 ntTSL 211.31□□□□□ -0.66e-21■■■□□ 15.6
NOLC1Q14978 ARVCF-211ENST00000495096 2549 ntTSL 222.37■■□□□ 1.174e-6■■■□□ 15.6
NOLC1Q14978 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.734e-6■■■□□ 15.6
NOLC1Q14978 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.544e-6■■■□□ 15.6
NOLC1Q14978 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.444e-6■■■□□ 15.6
NOLC1Q14978 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.434e-6■■■□□ 15.6
NOLC1Q14978 TIPIN-203ENST00000562124 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 517.49■□□□□ 0.392e-83■■■□□ 15.6
NOLC1Q14978 TIPIN-201ENST00000261881 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.422e-83■■■□□ 15.6
NOLC1Q14978 TIPIN-204ENST00000566524 1459 ntTSL 29.93□□□□□ -0.822e-83■■■□□ 15.6
NOLC1Q14978 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC4.2□□□□□ -1.742e-83■■■□□ 15.6
NOLC1Q14978 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC7.04□□□□□ -1.281e-323■■■□□ 15.6
NOLC1Q14978 COX4I1-217ENST00000569997 3946 nt10.99□□□□□ -0.657e-21■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 NCOA4-203ENST00000580070 1755 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.35e-6■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 NCOA4-202ENST00000579039 2211 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.415e-6■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 NCOA4-207ENST00000585132 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.632e-6■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 ATP5A1-206ENST00000587902 571 ntTSL 210.28□□□□□ -0.769e-8■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 NCOA4-205ENST00000583565 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.915e-6■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 NCOA4-201ENST00000578454 2307 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.945e-6■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 NCOA4-204ENST00000581486 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.962e-6■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 NCOA4-206ENST00000585056 2124 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.155e-6■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 CDYL-207ENST00000472453 1764 ntTSL 1 (best)28.14■■■□□ 2.093e-9■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.893e-9■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.373e-9■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 CDYL-202ENST00000343762 3241 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.153e-9■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 CDYL-201ENST00000328908 3419 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.483e-9■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 CDYL-208ENST00000483019 773 ntTSL 210.52□□□□□ -0.733e-9■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 CDYL-204ENST00000440139 690 ntTSL 38.91□□□□□ -0.983e-9■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 ATP5A1-204ENST00000586523 4547 nt7.45□□□□□ -1.223e-8■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11e-10■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 UBAC1-206ENST00000489050 864 ntTSL 310.21□□□□□ -0.771e-10■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.072e-6■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.242e-6■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 CNOT1-211ENST00000567188 7830 ntTSL 1 (best)6.9□□□□□ -1.312e-6■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.572e-6■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 RPL5-201ENST00000315741 681 ntTSL 514.68□□□□□ -0.065e-11■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 RPL5-202ENST00000370321 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.265e-11■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 RPL5-204ENST00000470843 694 ntTSL 34.62□□□□□ -1.675e-11■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 CCNB1IP1-206ENST00000437553 1686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.264e-49■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 CCNB1IP1-205ENST00000398169 1631 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.514e-49■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 CCNB1IP1-203ENST00000398160 1613 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.534e-49■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 CCNB1IP1-216ENST00000557665 1331 ntTSL 511.59□□□□□ -0.554e-49■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 CCNB1IP1-204ENST00000398163 1604 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.594e-49■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 CCNB1IP1-208ENST00000553516 669 ntTSL 211.07□□□□□ -0.644e-49■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 CCNB1IP1-202ENST00000358932 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.754e-49■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 CCNB1IP1-201ENST00000353689 1305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.914e-49■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 CCNB1IP1-214ENST00000556854 1294 ntTSL 58.49□□□□□ -1.054e-49■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 CCNB1IP1-213ENST00000556563 646 ntTSL 37.11□□□□□ -1.274e-49■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 CCNB1IP1-211ENST00000555348 505 ntTSL 43.83□□□□□ -1.84e-49■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 CCNB1IP1-207ENST00000553291 392 ntTSL 32.8□□□□□ -1.964e-49■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 SPP1-206ENST00000508002 568 ntTSL 1 (best)5.55□□□□□ -1.521e-6■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 SPP1-205ENST00000505146 252 ntTSL 34.83□□□□□ -1.641e-6■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.191e-43■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 APOH-203ENST00000581797 748 ntTSL 36.99□□□□□ -1.291e-43■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 APOH-202ENST00000577982 707 ntTSL 54.54□□□□□ -1.681e-43■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 SHMT2-231ENST00000557433 1904 ntTSL 1 (best)19.51■□□□□ 0.711e-8■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.711e-8■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.381e-8■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 SHMT2-226ENST00000556825 2215 ntTSL 1 (best)16.98■□□□□ 0.311e-8■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 SHMT2-222ENST00000555774 2311 ntTSL 1 (best)15.92■□□□□ 0.141e-8■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 SHMT2-217ENST00000555116 1885 ntTSL 215.56■□□□□ 0.081e-8■■■□□ 15.5
Retrieved 100 of 7,921 protein–RNA pairs in 86.5 ms