Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IRF3Q14653 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IRF3Q14653 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IRF3Q14653 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
IRF3Q14653 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IRF3Q14653 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IRF3Q14653 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF3Q14653 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF3Q14653 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF3Q14653 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF3Q14653 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF3Q14653 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF3Q14653 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF3Q14653 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF3Q14653 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF3Q14653 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF3Q14653 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF3Q14653 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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IRF3Q14653 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF3Q14653 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF3Q14653 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF3Q14653 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF3Q14653 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF3Q14653 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF3Q14653 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF3Q14653 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF3Q14653 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF3Q14653 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF3Q14653 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF3Q14653 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF3Q14653 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF3Q14653 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF3Q14653 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF3Q14653 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF3Q14653 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF3Q14653 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF3Q14653 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF3Q14653 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF3Q14653 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF3Q14653 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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IRF3Q14653 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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IRF3Q14653 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF3Q14653 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF3Q14653 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF3Q14653 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF3Q14653 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF3Q14653 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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IRF3Q14653 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF3Q14653 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF3Q14653 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF3Q14653 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF3Q14653 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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IRF3Q14653 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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IRF3Q14653 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
IRF3Q14653 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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IRF3Q14653 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF3Q14653 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF3Q14653 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF3Q14653 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF3Q14653 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF3Q14653 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF3Q14653 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF3Q14653 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF3Q14653 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF3Q14653 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF3Q14653 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF3Q14653 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF3Q14653 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF3Q14653 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF3Q14653 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF3Q14653 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF3Q14653 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF3Q14653 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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