Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDE1CQ14123 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
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