Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CUL4BQ13620 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CUL4BQ13620 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CUL4BQ13620 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CUL4BQ13620 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CUL4BQ13620 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUL4BQ13620 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUL4BQ13620 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUL4BQ13620 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUL4BQ13620 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUL4BQ13620 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUL4BQ13620 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUL4BQ13620 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUL4BQ13620 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUL4BQ13620 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUL4BQ13620 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUL4BQ13620 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUL4BQ13620 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUL4BQ13620 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUL4BQ13620 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUL4BQ13620 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUL4BQ13620 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CUL4BQ13620 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUL4BQ13620 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUL4BQ13620 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUL4BQ13620 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUL4BQ13620 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUL4BQ13620 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUL4BQ13620 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUL4BQ13620 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUL4BQ13620 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUL4BQ13620 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CUL4BQ13620 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CUL4BQ13620 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CUL4BQ13620 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CUL4BQ13620 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CUL4BQ13620 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CUL4BQ13620 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CUL4BQ13620 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
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