Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CUL3Q13618 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CUL3Q13618 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CUL3Q13618 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CUL3Q13618 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CUL3Q13618 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CUL3Q13618 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CUL3Q13618 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CUL3Q13618 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL3Q13618 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL3Q13618 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL3Q13618 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL3Q13618 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL3Q13618 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL3Q13618 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL3Q13618 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL3Q13618 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL3Q13618 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL3Q13618 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL3Q13618 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL3Q13618 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL3Q13618 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL3Q13618 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL3Q13618 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL3Q13618 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL3Q13618 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL3Q13618 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL3Q13618 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CUL3Q13618 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CUL3Q13618 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CUL3Q13618 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CUL3Q13618 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CUL3Q13618 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CUL3Q13618 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CUL3Q13618 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CUL3Q13618 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CUL3Q13618 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CUL3Q13618 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CUL3Q13618 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CUL3Q13618 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CUL3Q13618 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CUL3Q13618 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CUL3Q13618 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CUL3Q13618 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CUL3Q13618 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CUL3Q13618 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CUL3Q13618 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL3Q13618 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL3Q13618 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL3Q13618 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL3Q13618 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL3Q13618 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL3Q13618 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL3Q13618 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL3Q13618 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL3Q13618 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL3Q13618 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL3Q13618 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL3Q13618 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL3Q13618 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL3Q13618 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL3Q13618 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL3Q13618 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL3Q13618 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL3Q13618 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL3Q13618 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL3Q13618 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL3Q13618 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL3Q13618 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL3Q13618 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL3Q13618 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL3Q13618 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CUL3Q13618 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CUL3Q13618 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CUL3Q13618 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CUL3Q13618 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CUL3Q13618 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CUL3Q13618 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CUL3Q13618 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CUL3Q13618 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL3Q13618 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL3Q13618 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL3Q13618 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL3Q13618 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL3Q13618 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL3Q13618 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL3Q13618 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL3Q13618 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL3Q13618 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CUL3Q13618 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CUL3Q13618 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CUL3Q13618 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CUL3Q13618 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CUL3Q13618 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CUL3Q13618 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CUL3Q13618 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CUL3Q13618 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CUL3Q13618 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CUL3Q13618 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
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