Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
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