Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
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