Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 MAP4-207ENST00000426837 8920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.66e-7■■■□□ 16.6
G3BP1Q13283 IMPDH2-211ENST00000491610 844 ntTSL 512.72□□□□□ -0.372e-7■■■□□ 16.6
G3BP1Q13283 IMPDH2-203ENST00000442157 865 ntTSL 212□□□□□ -0.492e-7■■■□□ 16.6
G3BP1Q13283 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.763e-9■■■□□ 16.6
G3BP1Q13283 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.273e-6■■■□□ 16.6
G3BP1Q13283 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.623e-6■■■□□ 16.6
G3BP1Q13283 CCT3-215ENST00000496684 748 ntTSL 29.11□□□□□ -0.955e-7■■■□□ 16.6
G3BP1Q13283 CCT3-216ENST00000533194 581 ntTSL 38.87□□□□□ -0.995e-7■■■□□ 16.6
G3BP1Q13283 CCT3-207ENST00000413555 842 ntTSL 57.08□□□□□ -1.285e-7■■■□□ 16.6
G3BP1Q13283 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.419e-7■■■□□ 16.6
G3BP1Q13283 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.359e-7■■■□□ 16.6
G3BP1Q13283 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.349e-7■■■□□ 16.6
G3BP1Q13283 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.319e-7■■■□□ 16.6
G3BP1Q13283 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.39e-7■■■□□ 16.6
G3BP1Q13283 DDC-205ENST00000430300 1470 ntTSL 516.76■□□□□ 0.279e-7■■■□□ 16.6
G3BP1Q13283 DDC-201ENST00000357936 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.259e-7■■■□□ 16.6
G3BP1Q13283 DDC-206ENST00000431062 1620 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.239e-7■■■□□ 16.6
G3BP1Q13283 DDC-208ENST00000444733 1725 ntTSL 314.3□□□□□ -0.129e-7■■■□□ 16.6
G3BP1Q13283 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.789e-7■■■□□ 16.6
G3BP1Q13283 NUP214-203ENST00000451030 5021 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.313e-6■■■□□ 16.6
G3BP1Q13283 NUP214-201ENST00000359428 7600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.83e-6■■■□□ 16.6
G3BP1Q13283 NUP214-202ENST00000411637 7538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.913e-6■■■□□ 16.6
G3BP1Q13283 FBL-205ENST00000595545 896 ntTSL 210.26□□□□□ -0.774e-7■■■□□ 16.6
G3BP1Q13283 BAZ2A-213ENST00000551759 833 ntTSL 513.26□□□□□ -0.296e-10■■■□□ 16.6
G3BP1Q13283 LAP3-203ENST00000504614 813 ntTSL 36.68□□□□□ -1.349e-7■■■□□ 16.6
G3BP1Q13283 NMT1-208ENST00000588975 183 ntTSL 1 (best)19.2■□□□□ 0.663e-8■■■□□ 16.6
G3BP1Q13283 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.951e-6■■■□□ 16.6
G3BP1Q13283 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.91e-6■■■□□ 16.6
G3BP1Q13283 MYO1B-201ENST00000304164 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.911e-6■■■□□ 16.6
G3BP1Q13283 MYO1B-203ENST00000392316 4764 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.011e-6■■■□□ 16.6
G3BP1Q13283 PRPF19-206ENST00000541371 943 ntTSL 316.33■□□□□ 0.22e-6■■■□□ 16.6
G3BP1Q13283 LMNA-216ENST00000496738 2405 ntTSL 220.85■□□□□ 0.931e-8■■■□□ 16.6
G3BP1Q13283 NDUFV1-210ENST00000527923 594 ntTSL 223.74■■□□□ 1.391e-8■■■□□ 16.6
G3BP1Q13283 NDUFV1-220ENST00000531250 736 ntTSL 221.91■■□□□ 1.11e-8■■■□□ 16.6
G3BP1Q13283 NDUFV1-209ENST00000527355 679 ntTSL 217.66■□□□□ 0.421e-8■■■□□ 16.6
G3BP1Q13283 NDUFV1-226ENST00000533919 774 ntTSL 317.66■□□□□ 0.421e-8■■■□□ 16.6
G3BP1Q13283 SHMT2-206ENST00000553529 562 ntTSL 422.55■■□□□ 1.28e-8■■■□□ 16.6
G3BP1Q13283 SHMT2-204ENST00000553324 566 ntTSL 419.02■□□□□ 0.648e-8■■■□□ 16.6
G3BP1Q13283 SHMT2-235ENST00000557740 569 ntTSL 418.08■□□□□ 0.488e-8■■■□□ 16.6
G3BP1Q13283 SHMT2-210ENST00000553950 584 ntTSL 217.95■□□□□ 0.468e-8■■■□□ 16.6
G3BP1Q13283 SHMT2-219ENST00000555563 895 ntTSL 516.99■□□□□ 0.318e-8■■■□□ 16.6
G3BP1Q13283 SHMT2-234ENST00000557703 542 ntTSL 416.98■□□□□ 0.318e-8■■■□□ 16.6
G3BP1Q13283 SHMT2-211ENST00000554310 579 ntTSL 416.15■□□□□ 0.188e-8■■■□□ 16.6
G3BP1Q13283 SHMT2-227ENST00000557269 576 ntTSL 515.9■□□□□ 0.148e-8■■■□□ 16.6
G3BP1Q13283 SHMT2-223ENST00000556689 768 ntTSL 315.58■□□□□ 0.088e-8■■■□□ 16.6
G3BP1Q13283 SHMT2-221ENST00000555773 600 ntTSL 215.47■□□□□ 0.078e-8■■■□□ 16.6
G3BP1Q13283 SHMT2-214ENST00000554604 879 ntTSL 515.3■□□□□ 0.048e-8■■■□□ 16.6
G3BP1Q13283 SHMT2-230ENST00000557427 569 ntTSL 415.25■□□□□ 0.038e-8■■■□□ 16.6
G3BP1Q13283 SHMT2-209ENST00000553949 552 ntTSL 315.18■□□□□ 0.028e-8■■■□□ 16.6
G3BP1Q13283 SHMT2-220ENST00000555634 964 ntTSL 513.86□□□□□ -0.198e-8■■■□□ 16.6
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G3BP1Q13283 SHMT2-215ENST00000554656 817 ntTSL 313.01□□□□□ -0.338e-8■■■□□ 16.6
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G3BP1Q13283 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.066e-6■■■□□ 16.6
G3BP1Q13283 GOT2-207ENST00000568368 516 ntTSL 415.76■□□□□ 0.111e-7■■■□□ 16.6
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G3BP1Q13283 ESYT1-206ENST00000550515 716 ntTSL 215.42■□□□□ 0.062e-6■■■□□ 16.5
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G3BP1Q13283 WDR43-202ENST00000407426 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.074e-6■■■□□ 16.5
G3BP1Q13283 PSMC2-204ENST00000457587 682 ntTSL 312.89□□□□□ -0.354e-6■■■□□ 16.5
G3BP1Q13283 MYLK-217ENST00000514623 3108 ntTSL 212.86□□□□□ -0.351e-6■■■□□ 16.5
G3BP1Q13283 URB1-201ENST00000382751 10832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.822e-8■■■□□ 16.5
G3BP1Q13283 PSMC2-202ENST00000425206 656 ntTSL 39.92□□□□□ -0.824e-6■■■□□ 16.5
G3BP1Q13283 ADD1-228ENST00000541843 406 ntTSL 38.49□□□□□ -1.052e-8■■■□□ 16.5
G3BP1Q13283 PSMC2-205ENST00000460021 733 ntTSL 25.21□□□□□ -1.584e-6■■■□□ 16.5
G3BP1Q13283 WDR43-201ENST00000296126 787 ntTSL 54.53□□□□□ -1.684e-6■■■□□ 16.5
G3BP1Q13283 SCRN1-204ENST00000421434 1001 ntTSL 311.56□□□□□ -0.562e-7■■■□□ 16.5
G3BP1Q13283 LAP3-205ENST00000508014 494 ntTSL 417.56■□□□□ 0.43e-6■■■□□ 16.5
G3BP1Q13283 DDB1-221ENST00000543162 575 ntTSL 413.22□□□□□ -0.296e-9■■■□□ 16.5
G3BP1Q13283 EFTUD2-224ENST00000592701 562 ntTSL 413.58□□□□□ -0.243e-10■■■□□ 16.5
G3BP1Q13283 EFTUD2-222ENST00000592408 561 ntTSL 411.09□□□□□ -0.633e-10■■■□□ 16.5
G3BP1Q13283 PSMD2-204ENST00000433010 942 ntTSL 325.93■■□□□ 1.746e-7■■■□□ 16.5
G3BP1Q13283 PSMD2-215ENST00000487475 910 ntTSL 221.41■■□□□ 1.026e-7■■■□□ 16.5
G3BP1Q13283 COPZ1-207ENST00000549116 736 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.082e-6■■■□□ 16.5
G3BP1Q13283 COPZ1-206ENST00000549043 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.012e-6■■■□□ 16.5
G3BP1Q13283 COPZ1-204ENST00000548281 554 ntTSL 414.45□□□□□ -0.12e-6■■■□□ 16.5
G3BP1Q13283 COPZ1-202ENST00000455864 880 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.192e-6■■■□□ 16.5
G3BP1Q13283 COPZ1-213ENST00000551962 578 ntTSL 513.85□□□□□ -0.192e-6■■■□□ 16.5
G3BP1Q13283 COPZ1-214ENST00000552218 797 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.282e-6■■■□□ 16.5
G3BP1Q13283 COPZ1-201ENST00000262061 1897 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.322e-6■■■□□ 16.5
G3BP1Q13283 COPZ1-212ENST00000551779 1462 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.52e-6■■■□□ 16.5
G3BP1Q13283 COPZ1-209ENST00000550171 1026 ntTSL 211.59□□□□□ -0.552e-6■■■□□ 16.5
G3BP1Q13283 COPZ1-215ENST00000552362 575 ntTSL 4 BASIC9.78□□□□□ -0.842e-6■■■□□ 16.5
G3BP1Q13283 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.192e-6■■■□□ 16.5
G3BP1Q13283 DCTN1-221ENST00000491465 2444 ntTSL 1 (best)17.76■□□□□ 0.437e-7■■■□□ 16.5
G3BP1Q13283 DDB1-213ENST00000539332 1767 ntTSL 210.8□□□□□ -0.689e-8■■■□□ 16.5
G3BP1Q13283 IDH1-208ENST00000481557 556 ntTSL 215.06■□□□□ 01e-12■■■□□ 16.5
G3BP1Q13283 FDPS-212ENST00000487002 2017 ntTSL 220.53■□□□□ 0.882e-7■■■□□ 16.5
G3BP1Q13283 CCT3-209ENST00000446905 593 ntTSL 36.07□□□□□ -1.445e-7■■■□□ 16.5
G3BP1Q13283 CCT3-210ENST00000463132 610 ntTSL 35.55□□□□□ -1.525e-7■■■□□ 16.5
G3BP1Q13283 PRMT5-207ENST00000476175 682 ntTSL 28.69□□□□□ -1.024e-7■■■□□ 16.5
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