Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTGDRQ13258 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTGDRQ13258 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTGDRQ13258 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTGDRQ13258 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTGDRQ13258 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTGDRQ13258 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTGDRQ13258 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTGDRQ13258 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTGDRQ13258 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTGDRQ13258 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTGDRQ13258 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTGDRQ13258 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PTGDRQ13258 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTGDRQ13258 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTGDRQ13258 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTGDRQ13258 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTGDRQ13258 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTGDRQ13258 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTGDRQ13258 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTGDRQ13258 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTGDRQ13258 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTGDRQ13258 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTGDRQ13258 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTGDRQ13258 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTGDRQ13258 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTGDRQ13258 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
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