Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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