Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RESTQ13127 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RESTQ13127 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RESTQ13127 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RESTQ13127 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RESTQ13127 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RESTQ13127 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RESTQ13127 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RESTQ13127 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RESTQ13127 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RESTQ13127 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RESTQ13127 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RESTQ13127 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RESTQ13127 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RESTQ13127 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RESTQ13127 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RESTQ13127 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RESTQ13127 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RESTQ13127 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RESTQ13127 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RESTQ13127 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RESTQ13127 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RESTQ13127 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RESTQ13127 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RESTQ13127 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RESTQ13127 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RESTQ13127 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RESTQ13127 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RESTQ13127 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RESTQ13127 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RESTQ13127 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RESTQ13127 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RESTQ13127 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RESTQ13127 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RESTQ13127 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RESTQ13127 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RESTQ13127 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RESTQ13127 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RESTQ13127 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RESTQ13127 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RESTQ13127 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RESTQ13127 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RESTQ13127 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RESTQ13127 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RESTQ13127 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RESTQ13127 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RESTQ13127 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RESTQ13127 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RESTQ13127 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RESTQ13127 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RESTQ13127 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RESTQ13127 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RESTQ13127 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RESTQ13127 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RESTQ13127 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RESTQ13127 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RESTQ13127 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RESTQ13127 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RESTQ13127 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RESTQ13127 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RESTQ13127 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
RESTQ13127 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RESTQ13127 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RESTQ13127 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RESTQ13127 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RESTQ13127 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RESTQ13127 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RESTQ13127 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RESTQ13127 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RESTQ13127 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RESTQ13127 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RESTQ13127 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RESTQ13127 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RESTQ13127 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RESTQ13127 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RESTQ13127 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RESTQ13127 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RESTQ13127 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RESTQ13127 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RESTQ13127 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RESTQ13127 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RESTQ13127 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RESTQ13127 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RESTQ13127 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RESTQ13127 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RESTQ13127 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RESTQ13127 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RESTQ13127 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RESTQ13127 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RESTQ13127 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RESTQ13127 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RESTQ13127 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RESTQ13127 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RESTQ13127 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RESTQ13127 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RESTQ13127 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RESTQ13127 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RESTQ13127 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RESTQ13127 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RESTQ13127 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
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