Protein–RNA interactions for Protein: Q13113

PDZK1IP1, PDZK1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1IP1Q13113 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PDZK1IP1Q13113 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PDZK1IP1Q13113 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PDZK1IP1Q13113 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDZK1IP1Q13113 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDZK1IP1Q13113 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDZK1IP1Q13113 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PDZK1IP1Q13113 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PDZK1IP1Q13113 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDZK1IP1Q13113 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDZK1IP1Q13113 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms