Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
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