Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NFX1Q12986 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
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