Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNH2Q12809 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNH2Q12809 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNH2Q12809 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNH2Q12809 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNH2Q12809 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNH2Q12809 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNH2Q12809 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNH2Q12809 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNH2Q12809 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNH2Q12809 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNH2Q12809 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNH2Q12809 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNH2Q12809 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNH2Q12809 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNH2Q12809 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNH2Q12809 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNH2Q12809 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNH2Q12809 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNH2Q12809 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNH2Q12809 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNH2Q12809 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNH2Q12809 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNH2Q12809 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNH2Q12809 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNH2Q12809 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNH2Q12809 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNH2Q12809 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNH2Q12809 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNH2Q12809 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNH2Q12809 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNH2Q12809 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNH2Q12809 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNH2Q12809 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNH2Q12809 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNH2Q12809 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNH2Q12809 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNH2Q12809 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNH2Q12809 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNH2Q12809 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNH2Q12809 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNH2Q12809 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNH2Q12809 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNH2Q12809 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNH2Q12809 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNH2Q12809 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNH2Q12809 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNH2Q12809 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNH2Q12809 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNH2Q12809 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNH2Q12809 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNH2Q12809 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNH2Q12809 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNH2Q12809 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNH2Q12809 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNH2Q12809 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNH2Q12809 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNH2Q12809 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNH2Q12809 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
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