Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
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