Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
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