Protein–RNA interactions for Protein: Q12378

RTR2, RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RTR2, yeastyeast

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTR2Q12378 FRA2YGL220W 363 nt3.66□□□□□ -1.82
RTR2Q12378 SCD6YPR129W 1050 nt3.66□□□□□ -1.82
RTR2Q12378 SPN1YPR133C 1233 nt3.66□□□□□ -1.82
RTR2Q12378 YRM1YOR172W 2361 nt3.66□□□□□ -1.82
RTR2Q12378 CHL1YPL008W 2586 nt3.65□□□□□ -1.82
RTR2Q12378 UBP6YFR010W 1500 nt3.65□□□□□ -1.82
RTR2Q12378 MNT4YNR059W 1743 nt3.65□□□□□ -1.82
RTR2Q12378 GAS4YOL132W 1416 nt3.65□□□□□ -1.83
RTR2Q12378 YFT2YDR319C 825 nt3.65□□□□□ -1.83
RTR2Q12378 tL(UAG)JtL(UAG)J 82 nt3.65□□□□□ -1.83
RTR2Q12378 tL(UAG)L1tL(UAG)L1 82 nt3.65□□□□□ -1.83
RTR2Q12378 tL(UAG)L2tL(UAG)L2 82 nt3.65□□□□□ -1.83
RTR2Q12378 CNB1YKL190W 528 nt3.65□□□□□ -1.83
RTR2Q12378 RDN5-1RDN5-1 121 nt3.65□□□□□ -1.83
RTR2Q12378 RDN5-6RDN5-6 121 nt3.65□□□□□ -1.83
RTR2Q12378 HEM15YOR176W 1182 nt3.65□□□□□ -1.83
RTR2Q12378 YOR379CYOR379C 339 nt3.65□□□□□ -1.83
RTR2Q12378 FOX2YKR009C 2703 nt3.65□□□□□ -1.83
RTR2Q12378 HPR1YDR138W 2259 nt3.65□□□□□ -1.83
RTR2Q12378 MEF2YJL102W 2460 nt3.65□□□□□ -1.83
RTR2Q12378 MET3YJR010W 1536 nt3.65□□□□□ -1.83
RTR2Q12378 HEF3YNL014W 3135 nt3.64□□□□□ -1.83
RTR2Q12378 OCA4YCR095C 1089 nt3.64□□□□□ -1.83
RTR2Q12378 YER134CYER134C 537 nt3.64□□□□□ -1.83
RTR2Q12378 FMP10YER182W 735 nt3.64□□□□□ -1.83
RTR2Q12378 TYS1YGR185C 1185 nt3.64□□□□□ -1.83
RTR2Q12378 PAU17YLL025W 375 nt3.64□□□□□ -1.83
RTR2Q12378 YLR154W-BYLR154W-B 165 nt3.64□□□□□ -1.83
RTR2Q12378 MID2YLR332W 1131 nt3.64□□□□□ -1.83
RTR2Q12378 RER1YCL001W 567 nt3.64□□□□□ -1.83
RTR2Q12378 ZRC1YMR243C 1329 nt3.64□□□□□ -1.83
RTR2Q12378 KRI1YNL308C 1776 nt3.63□□□□□ -1.83
RTR2Q12378 RPL18BYNL301C 561 nt3.63□□□□□ -1.83
RTR2Q12378 YPR059CYPR059C 387 nt3.63□□□□□ -1.83
RTR2Q12378 GDH2YDL215C 3279 nt3.63□□□□□ -1.83
RTR2Q12378 GCN5YGR252W 1320 nt3.63□□□□□ -1.83
RTR2Q12378 YDR133CYDR133C 336 nt3.62□□□□□ -1.83
RTR2Q12378 CAP2YIL034C 864 nt3.62□□□□□ -1.83
RTR2Q12378 YMR082CYMR082C 357 nt3.62□□□□□ -1.83
RTR2Q12378 RPS19AYOL121C 435 nt3.62□□□□□ -1.83
RTR2Q12378 MTC4YBR255W 2085 nt3.62□□□□□ -1.83
RTR2Q12378 ALG9YNL219C 1668 nt3.62□□□□□ -1.83
RTR2Q12378 ECM16YMR128W 3804 nt3.61□□□□□ -1.83
RTR2Q12378 YER034WYER034W 558 nt3.61□□□□□ -1.83
RTR2Q12378 SPI1YER150W 447 nt3.61□□□□□ -1.83
RTR2Q12378 RRP36YOR287C 903 nt3.61□□□□□ -1.83
RTR2Q12378 FRM2YCL026C-A 582 nt3.61□□□□□ -1.83
RTR2Q12378 MNN4YKL201C 3537 nt3.61□□□□□ -1.83
RTR2Q12378 GWT1YJL091C 1473 nt3.6□□□□□ -1.83
RTR2Q12378 ATG21YPL100W 1491 nt3.6□□□□□ -1.83
RTR2Q12378 STU1YBL034C 4542 nt3.6□□□□□ -1.83
RTR2Q12378 NSP1YJL041W 2472 nt3.6□□□□□ -1.83
RTR2Q12378 DPB2YPR175W 2070 nt3.6□□□□□ -1.83
RTR2Q12378 ELO2YCR034W 1044 nt3.6□□□□□ -1.83
RTR2Q12378 RPS4BYHR203C 786 nt3.6□□□□□ -1.83
RTR2Q12378 RPS4AYJR145C 786 nt3.6□□□□□ -1.83
RTR2Q12378 MRPL20YKR085C 588 nt3.6□□□□□ -1.83
RTR2Q12378 ADD37YMR184W 597 nt3.6□□□□□ -1.83
RTR2Q12378 ROT1YMR200W 771 nt3.6□□□□□ -1.83
RTR2Q12378 IDS2YJL146W 1410 nt3.6□□□□□ -1.83
RTR2Q12378 RTS1YOR014W 2274 nt3.59□□□□□ -1.83
RTR2Q12378 PRT1YOR361C 2292 nt3.59□□□□□ -1.83
RTR2Q12378 UBC8YEL012W 657 nt3.59□□□□□ -1.83
RTR2Q12378 YHL026CYHL026C 948 nt3.59□□□□□ -1.83
RTR2Q12378 SPS18YNL204C 903 nt3.59□□□□□ -1.83
RTR2Q12378 ADY3YDL239C 2373 nt3.59□□□□□ -1.84
RTR2Q12378 GZF3YJL110C 1656 nt3.59□□□□□ -1.84
RTR2Q12378 YJR030CYJR030C 2238 nt3.58□□□□□ -1.84
RTR2Q12378 YDR464C-AYDR464C-A 189 nt3.58□□□□□ -1.84
RTR2Q12378 SPT4YGR063C 309 nt3.58□□□□□ -1.84
RTR2Q12378 REC104YHR157W 549 nt3.58□□□□□ -1.84
RTR2Q12378 FMP46YKR049C 402 nt3.58□□□□□ -1.84
RTR2Q12378 YBR056W-AYBR056W-A 201 nt3.58□□□□□ -1.84
RTR2Q12378 PHM7YOL084W 2976 nt3.58□□□□□ -1.84
RTR2Q12378 GCR1YPL075W 2358 nt3.58□□□□□ -1.84
RTR2Q12378 FLO8YER109C 2400 nt3.58□□□□□ -1.84
RTR2Q12378 YHR095WYHR095W 495 nt3.57□□□□□ -1.84
RTR2Q12378 FLO10YKR102W 3510 nt3.57□□□□□ -1.84
RTR2Q12378 SUL2YLR092W 2682 nt3.57□□□□□ -1.84
RTR2Q12378 KIN2YLR096W 3444 nt3.57□□□□□ -1.84
RTR2Q12378 RNT1YMR239C 1416 nt3.57□□□□□ -1.84
RTR2Q12378 RRP40YOL142W 723 nt3.57□□□□□ -1.84
RTR2Q12378 GLN4YOR168W 2430 nt3.56□□□□□ -1.84
RTR2Q12378 REB1YBR049C 2433 nt3.56□□□□□ -1.84
RTR2Q12378 RNA14YMR061W 2034 nt3.56□□□□□ -1.84
RTR2Q12378 APP1YNL094W 1764 nt3.56□□□□□ -1.84
RTR2Q12378 OSH3YHR073W 2991 nt3.56□□□□□ -1.84
RTR2Q12378 SPC19YDR201W 498 nt3.56□□□□□ -1.84
RTR2Q12378 RPB3YIL021W 957 nt3.56□□□□□ -1.84
RTR2Q12378 YBR103C-AYBR103C-A 144 nt3.56□□□□□ -1.84
RTR2Q12378 GCD1YOR260W 1737 nt3.56□□□□□ -1.84
RTR2Q12378 IFM1YOL023W 2031 nt3.55□□□□□ -1.84
RTR2Q12378 AIM7YDR063W 450 nt3.55□□□□□ -1.84
RTR2Q12378 SEC53YFL045C 765 nt3.55□□□□□ -1.84
RTR2Q12378 YML031C-AYML031C-A 336 nt3.55□□□□□ -1.84
RTR2Q12378 APE2YKL157W 2859 nt3.55□□□□□ -1.84
RTR2Q12378 FMP30YPL103C 1407 nt3.54□□□□□ -1.84
RTR2Q12378 TMA17YDL110C 453 nt3.54□□□□□ -1.84
RTR2Q12378 DPB4YDR121W 591 nt3.54□□□□□ -1.84
RTR2Q12378 SPR28YDR218C 1272 nt3.54□□□□□ -1.84
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