Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms