Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE4DQ08499 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE4DQ08499 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE4DQ08499 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE4DQ08499 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE4DQ08499 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE4DQ08499 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE4DQ08499 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE4DQ08499 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE4DQ08499 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE4DQ08499 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE4DQ08499 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE4DQ08499 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE4DQ08499 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE4DQ08499 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE4DQ08499 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE4DQ08499 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE4DQ08499 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE4DQ08499 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE4DQ08499 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE4DQ08499 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE4DQ08499 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE4DQ08499 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE4DQ08499 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE4DQ08499 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE4DQ08499 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE4DQ08499 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE4DQ08499 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE4DQ08499 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE4DQ08499 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE4DQ08499 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE4DQ08499 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE4DQ08499 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE4DQ08499 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE4DQ08499 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE4DQ08499 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE4DQ08499 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE4DQ08499 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE4DQ08499 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE4DQ08499 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE4DQ08499 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE4DQ08499 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE4DQ08499 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE4DQ08499 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE4DQ08499 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms