Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
GOLGA3Q08378 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
GOLGA3Q08378 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
GOLGA3Q08378 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
GOLGA3Q08378 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
GOLGA3Q08378 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
GOLGA3Q08378 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
GOLGA3Q08378 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
GOLGA3Q08378 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
GOLGA3Q08378 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
GOLGA3Q08378 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
GOLGA3Q08378 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
GOLGA3Q08378 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
GOLGA3Q08378 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
GOLGA3Q08378 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
GOLGA3Q08378 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
GOLGA3Q08378 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
GOLGA3Q08378 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
GOLGA3Q08378 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
GOLGA3Q08378 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
GOLGA3Q08378 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
GOLGA3Q08378 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
GOLGA3Q08378 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
GOLGA3Q08378 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
GOLGA3Q08378 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
GOLGA3Q08378 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC36.35■■■■□ 3.41
GOLGA3Q08378 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
GOLGA3Q08378 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
GOLGA3Q08378 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
GOLGA3Q08378 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
GOLGA3Q08378 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
GOLGA3Q08378 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
GOLGA3Q08378 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
GOLGA3Q08378 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
GOLGA3Q08378 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
GOLGA3Q08378 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
GOLGA3Q08378 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
GOLGA3Q08378 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
GOLGA3Q08378 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
GOLGA3Q08378 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
GOLGA3Q08378 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
GOLGA3Q08378 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
GOLGA3Q08378 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
GOLGA3Q08378 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
GOLGA3Q08378 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
GOLGA3Q08378 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
GOLGA3Q08378 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
GOLGA3Q08378 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
GOLGA3Q08378 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.41
GOLGA3Q08378 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.41
GOLGA3Q08378 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
GOLGA3Q08378 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
GOLGA3Q08378 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
GOLGA3Q08378 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
GOLGA3Q08378 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
GOLGA3Q08378 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
GOLGA3Q08378 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
GOLGA3Q08378 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
GOLGA3Q08378 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
GOLGA3Q08378 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
GOLGA3Q08378 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
GOLGA3Q08378 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
GOLGA3Q08378 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
GOLGA3Q08378 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
GOLGA3Q08378 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
GOLGA3Q08378 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
GOLGA3Q08378 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
GOLGA3Q08378 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
GOLGA3Q08378 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
GOLGA3Q08378 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
GOLGA3Q08378 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC36.29■■■■□ 3.4
GOLGA3Q08378 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
GOLGA3Q08378 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
GOLGA3Q08378 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
GOLGA3Q08378 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
GOLGA3Q08378 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
GOLGA3Q08378 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
GOLGA3Q08378 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
GOLGA3Q08378 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
GOLGA3Q08378 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
GOLGA3Q08378 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
GOLGA3Q08378 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
GOLGA3Q08378 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
GOLGA3Q08378 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
GOLGA3Q08378 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
GOLGA3Q08378 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
GOLGA3Q08378 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
GOLGA3Q08378 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
GOLGA3Q08378 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
GOLGA3Q08378 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC36.27■■■■□ 3.4
GOLGA3Q08378 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
GOLGA3Q08378 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
GOLGA3Q08378 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
GOLGA3Q08378 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
GOLGA3Q08378 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
GOLGA3Q08378 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
GOLGA3Q08378 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
GOLGA3Q08378 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
GOLGA3Q08378 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
GOLGA3Q08378 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms