Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LTBQ06643 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LTBQ06643 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LTBQ06643 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LTBQ06643 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LTBQ06643 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LTBQ06643 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LTBQ06643 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LTBQ06643 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LTBQ06643 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LTBQ06643 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LTBQ06643 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LTBQ06643 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LTBQ06643 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LTBQ06643 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LTBQ06643 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LTBQ06643 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LTBQ06643 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LTBQ06643 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LTBQ06643 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LTBQ06643 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LTBQ06643 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LTBQ06643 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LTBQ06643 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LTBQ06643 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LTBQ06643 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LTBQ06643 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LTBQ06643 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LTBQ06643 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LTBQ06643 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LTBQ06643 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTBQ06643 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTBQ06643 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTBQ06643 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LTBQ06643 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTBQ06643 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTBQ06643 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTBQ06643 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTBQ06643 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTBQ06643 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTBQ06643 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTBQ06643 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LTBQ06643 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LTBQ06643 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LTBQ06643 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LTBQ06643 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LTBQ06643 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LTBQ06643 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LTBQ06643 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LTBQ06643 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LTBQ06643 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTBQ06643 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTBQ06643 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTBQ06643 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTBQ06643 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTBQ06643 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTBQ06643 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTBQ06643 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTBQ06643 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTBQ06643 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTBQ06643 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LTBQ06643 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LTBQ06643 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LTBQ06643 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LTBQ06643 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LTBQ06643 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LTBQ06643 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LTBQ06643 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LTBQ06643 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LTBQ06643 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LTBQ06643 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LTBQ06643 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTBQ06643 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTBQ06643 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTBQ06643 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTBQ06643 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTBQ06643 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTBQ06643 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTBQ06643 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTBQ06643 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LTBQ06643 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTBQ06643 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTBQ06643 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTBQ06643 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTBQ06643 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LTBQ06643 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTBQ06643 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTBQ06643 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTBQ06643 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTBQ06643 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTBQ06643 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTBQ06643 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LTBQ06643 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LTBQ06643 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LTBQ06643 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LTBQ06643 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LTBQ06643 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LTBQ06643 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LTBQ06643 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LTBQ06643 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms