Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms