Protein–RNA interactions for Protein: Q06141

REG3A, Regenerating islet-derived protein 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG3AQ06141 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms