Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNB1Q02641 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNB1Q02641 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNB1Q02641 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNB1Q02641 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNB1Q02641 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNB1Q02641 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNB1Q02641 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNB1Q02641 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNB1Q02641 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNB1Q02641 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNB1Q02641 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNB1Q02641 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNB1Q02641 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNB1Q02641 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNB1Q02641 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNB1Q02641 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNB1Q02641 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNB1Q02641 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNB1Q02641 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNB1Q02641 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNB1Q02641 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNB1Q02641 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNB1Q02641 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNB1Q02641 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNB1Q02641 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNB1Q02641 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNB1Q02641 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNB1Q02641 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNB1Q02641 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNB1Q02641 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNB1Q02641 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNB1Q02641 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNB1Q02641 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNB1Q02641 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNB1Q02641 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNB1Q02641 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNB1Q02641 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 HIKESHI-201ENST00000278483 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 AC009269.5-201ENST00000557800 755 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms