Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms