Protein–RNA interactions for Protein: Q01081

U2AF1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1Q01081 XPO6-205ENST00000564337 605 ntTSL 516.17■□□□□ 0.186e-17■■■■□ 19.8
U2AF1Q01081 XPO6-208ENST00000565698 4255 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.036e-17■■■■□ 19.8
U2AF1Q01081 XPO6-210ENST00000566175 248 ntTSL 38.35□□□□□ -1.076e-17■■■■□ 19.8
U2AF1Q01081 TNFRSF10B-204ENST00000519028 612 ntTSL 227.36■■□□□ 1.974e-7■■■■□ 19.8
U2AF1Q01081 SFPQ-201ENST00000357214 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.135e-14■■■■□ 19.7
U2AF1Q01081 SFPQ-202ENST00000460428 464 ntTSL 210.6□□□□□ -0.715e-14■■■■□ 19.7
U2AF1Q01081 SFPQ-206ENST00000470472 874 ntTSL 55.23□□□□□ -1.575e-14■■■■□ 19.7
U2AF1Q01081 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.622e-6■■■■□ 19.7
U2AF1Q01081 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.352e-6■■■■□ 19.7
U2AF1Q01081 AP3S1-204ENST00000506430 718 ntTSL 523.16■■□□□ 1.32e-6■■■■□ 19.7
U2AF1Q01081 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.142e-6■■■■□ 19.7
U2AF1Q01081 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.892e-6■■■■□ 19.7
U2AF1Q01081 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.652e-6■■■■□ 19.7
U2AF1Q01081 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.642e-6■■■■□ 19.7
U2AF1Q01081 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.522e-6■■■■□ 19.7
U2AF1Q01081 MAPK14-206ENST00000474429 823 ntTSL 515.22■□□□□ 0.032e-6■■■■□ 19.7
U2AF1Q01081 PRRC2B-202ENST00000357304 11042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.222e-6■■■■□ 19.7
U2AF1Q01081 PRRC2B-203ENST00000405995 9157 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.472e-6■■■■□ 19.7
U2AF1Q01081 ACSL5-205ENST00000433418 3281 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.482e-6■■■■□ 19.7
U2AF1Q01081 SLMAP-203ENST00000383718 6749 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.492e-6■■■■□ 19.7
U2AF1Q01081 SLMAP-214ENST00000467901 2698 ntTSL 29.38□□□□□ -0.912e-6■■■■□ 19.7
U2AF1Q01081 MAPK14-203ENST00000310795 1066 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.912e-6■■■■□ 19.7
U2AF1Q01081 SLMAP-202ENST00000295952 4420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.922e-6■■■■□ 19.7
U2AF1Q01081 ACSL5-201ENST00000354273 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.942e-6■■■■□ 19.7
U2AF1Q01081 ACSL5-203ENST00000356116 3353 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.992e-6■■■■□ 19.7
U2AF1Q01081 MAPK14-209ENST00000496250 2750 ntTSL 1 (best)8.83□□□□□ -12e-6■■■■□ 19.7
U2AF1Q01081 MAPK14-208ENST00000491957 2777 ntTSL 1 (best)8.65□□□□□ -1.022e-6■■■■□ 19.7
U2AF1Q01081 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.172e-6■■■■□ 19.7
U2AF1Q01081 UBR3-204ENST00000430321 5411 ntTSL 57.41□□□□□ -1.222e-6■■■■□ 19.7
U2AF1Q01081 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.232e-6■■■■□ 19.7
U2AF1Q01081 AP3S1-202ENST00000395548 1180 ntTSL 1 (best)7.03□□□□□ -1.282e-6■■■■□ 19.7
U2AF1Q01081 ACSL5-208ENST00000495539 716 ntTSL 26.8□□□□□ -1.322e-6■■■■□ 19.7
U2AF1Q01081 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.352e-6■■■■□ 19.7
U2AF1Q01081 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.362e-6■■■■□ 19.7
U2AF1Q01081 AP3S1-203ENST00000505423 611 ntTSL 25.25□□□□□ -1.572e-6■■■■□ 19.7
U2AF1Q01081 UBR3-209ENST00000477461 595 ntTSL 45.07□□□□□ -1.62e-6■■■■□ 19.7
U2AF1Q01081 UBR3-202ENST00000392632 5129 ntTSL 54.95□□□□□ -1.622e-6■■■■□ 19.7
U2AF1Q01081 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.522e-8■■■■□ 19.6
U2AF1Q01081 SGK1-204ENST00000367858 3201 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.082e-8■■■■□ 19.6
U2AF1Q01081 SGK1-202ENST00000367855 2422 ntTSL 513.25□□□□□ -0.292e-8■■■■□ 19.6
U2AF1Q01081 SGK1-203ENST00000367857 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.382e-8■■■■□ 19.6
U2AF1Q01081 SGK1-211ENST00000475719 1383 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.392e-8■■■■□ 19.6
U2AF1Q01081 SGK1-201ENST00000237305 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.522e-8■■■■□ 19.6
U2AF1Q01081 SGK1-223ENST00000528577 1850 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.822e-8■■■■□ 19.6
U2AF1Q01081 SGK1-210ENST00000474427 5474 ntTSL 26.46□□□□□ -1.372e-8■■■■□ 19.6
U2AF1Q01081 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.221e-7■■■■□ 19.6
U2AF1Q01081 MAT2A-205ENST00000481412 1438 ntTSL 1 (best)16.94■□□□□ 0.31e-7■■■■□ 19.6
U2AF1Q01081 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.653e-13■■■■□ 19.5
U2AF1Q01081 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.991e-7■■■■□ 19.5
U2AF1Q01081 TANK-214ENST00000456358 564 ntTSL 517.73■□□□□ 0.431e-7■■■■□ 19.5
U2AF1Q01081 TANK-223ENST00000494976 636 ntTSL 317.47■□□□□ 0.391e-7■■■■□ 19.5
U2AF1Q01081 TANK-215ENST00000457887 762 ntTSL 515.24■□□□□ 0.031e-7■■■■□ 19.5
U2AF1Q01081 TANK-216ENST00000461338 674 ntTSL 311.99□□□□□ -0.491e-7■■■■□ 19.5
U2AF1Q01081 TANK-207ENST00000429217 762 ntTSL 511.99□□□□□ -0.491e-7■■■■□ 19.5
U2AF1Q01081 TANK-221ENST00000483622 566 ntTSL 510.66□□□□□ -0.71e-7■■■■□ 19.5
U2AF1Q01081 TANK-212ENST00000440506 550 ntTSL 39.31□□□□□ -0.921e-7■■■■□ 19.5
U2AF1Q01081 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.171e-7■■■■□ 19.5
U2AF1Q01081 TANK-213ENST00000441987 533 ntTSL 57.3□□□□□ -1.241e-7■■■■□ 19.5
U2AF1Q01081 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.321e-7■■■■□ 19.5
U2AF1Q01081 TANK-217ENST00000463502 570 ntTSL 36.15□□□□□ -1.421e-7■■■■□ 19.5
U2AF1Q01081 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.61e-7■■■■□ 19.5
U2AF1Q01081 TANK-220ENST00000477952 427 ntTSL 24.58□□□□□ -1.681e-7■■■■□ 19.5
U2AF1Q01081 TANK-209ENST00000432692 576 ntTSL 54.43□□□□□ -1.71e-7■■■■□ 19.5
U2AF1Q01081 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.811e-7■■■■□ 19.5
U2AF1Q01081 TANK-208ENST00000432002 600 ntTSL 53.61□□□□□ -1.831e-7■■■■□ 19.5
U2AF1Q01081 NUP160-207ENST00000528501 1961 ntTSL 222.45■■□□□ 1.182e-16■■■■□ 19.4
U2AF1Q01081 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.342e-16■■■■□ 19.4
U2AF1Q01081 NUP160-206ENST00000528071 4138 ntTSL 514.29□□□□□ -0.122e-16■■■■□ 19.4
U2AF1Q01081 NUP160-204ENST00000527126 527 ntTSL 212.51□□□□□ -0.412e-16■■■■□ 19.4
U2AF1Q01081 NUP160-209ENST00000530326 4811 ntAPPRIS ALT2 TSL 58.16□□□□□ -1.12e-16■■■■□ 19.4
U2AF1Q01081 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.411e-11■■■■□ 19.4
U2AF1Q01081 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.061e-11■■■■□ 19.4
U2AF1Q01081 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.841e-11■■■■□ 19.4
U2AF1Q01081 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.539e-23■■■■□ 19.4
U2AF1Q01081 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.329e-23■■■■□ 19.4
U2AF1Q01081 SCAF4-203ENST00000434667 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.299e-23■■■■□ 19.4
U2AF1Q01081 SCAF4-204ENST00000467731 2976 ntTSL 1 (best)9.14□□□□□ -0.959e-23■■■■□ 19.4
U2AF1Q01081 SCAF4-205ENST00000472318 796 ntTSL 38.34□□□□□ -1.079e-23■■■■□ 19.4
U2AF1Q01081 ZNF536-204ENST00000591488 655 ntTSL 322.62■■□□□ 1.216e-20■■■■□ 19.4
U2AF1Q01081 ZNF536-202ENST00000585628 3198 ntTSL 517.67■□□□□ 0.426e-20■■■■□ 19.4
U2AF1Q01081 KIF13A-201ENST00000259711 5941 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.271e-8■■■■□ 19.4
U2AF1Q01081 KIF13A-213ENST00000636847 5538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.441e-8■■■■□ 19.4
U2AF1Q01081 KIF13A-203ENST00000378814 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.541e-8■■■■□ 19.4
U2AF1Q01081 KIF13A-204ENST00000378826 5747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.561e-8■■■■□ 19.4
U2AF1Q01081 KIF13A-205ENST00000378843 5707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.951e-8■■■■□ 19.4
U2AF1Q01081 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.843e-6■■■■□ 19.4
U2AF1Q01081 ABL1-202ENST00000372348 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.063e-6■■■■□ 19.4
U2AF1Q01081 ABL1-203ENST00000393293 532 ntTSL 56.89□□□□□ -1.313e-6■■■■□ 19.4
U2AF1Q01081 SSR3-202ENST00000463503 596 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.072e-12■■■■□ 19.4
U2AF1Q01081 SSR3-205ENST00000467789 1039 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.22e-12■■■■□ 19.4
U2AF1Q01081 SSR3-201ENST00000265044 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.442e-12■■■■□ 19.4
U2AF1Q01081 SSR3-203ENST00000464138 533 ntTSL 37.39□□□□□ -1.232e-12■■■■□ 19.4
U2AF1Q01081 SSR3-207ENST00000478842 612 ntTSL 37.39□□□□□ -1.232e-12■■■■□ 19.4
U2AF1Q01081 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC7.18□□□□□ -1.262e-12■■■■□ 19.4
U2AF1Q01081 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.342e-12■■■■□ 19.4
U2AF1Q01081 SSR3-209ENST00000498205 593 ntTSL 26.18□□□□□ -1.422e-12■■■■□ 19.4
U2AF1Q01081 SSR3-204ENST00000467733 873 ntTSL 25.34□□□□□ -1.552e-12■■■■□ 19.4
U2AF1Q01081 EIF4G2-204ENST00000525606 690 ntTSL 24.18□□□□□ -1.742e-11■■■■□ 19.3
U2AF1Q01081 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.883e-8■■■■□ 19.3
U2AF1Q01081 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.173e-8■■■■□ 19.3
Retrieved 100 of 10,096 protein–RNA pairs in 47.8 ms