Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms