Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CLTCQ00610 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CLTCQ00610 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CLTCQ00610 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CLTCQ00610 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
CLTCQ00610 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CLTCQ00610 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
CLTCQ00610 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CLTCQ00610 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CLTCQ00610 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CLTCQ00610 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CLTCQ00610 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CLTCQ00610 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CLTCQ00610 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CLTCQ00610 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CLTCQ00610 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CLTCQ00610 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CLTCQ00610 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CLTCQ00610 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CLTCQ00610 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CLTCQ00610 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CLTCQ00610 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CLTCQ00610 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CLTCQ00610 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CLTCQ00610 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
CLTCQ00610 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CLTCQ00610 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CLTCQ00610 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CLTCQ00610 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CLTCQ00610 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CLTCQ00610 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CLTCQ00610 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CLTCQ00610 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CLTCQ00610 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CLTCQ00610 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CLTCQ00610 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CLTCQ00610 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CLTCQ00610 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CLTCQ00610 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CLTCQ00610 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CLTCQ00610 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
CLTCQ00610 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
CLTCQ00610 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CLTCQ00610 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CLTCQ00610 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CLTCQ00610 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CLTCQ00610 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CLTCQ00610 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CLTCQ00610 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CLTCQ00610 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CLTCQ00610 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CLTCQ00610 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CLTCQ00610 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CLTCQ00610 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CLTCQ00610 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CLTCQ00610 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
CLTCQ00610 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CLTCQ00610 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CLTCQ00610 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CLTCQ00610 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CLTCQ00610 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
CLTCQ00610 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
CLTCQ00610 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CLTCQ00610 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CLTCQ00610 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CLTCQ00610 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CLTCQ00610 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CLTCQ00610 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CLTCQ00610 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CLTCQ00610 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CLTCQ00610 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CLTCQ00610 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CLTCQ00610 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CLTCQ00610 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CLTCQ00610 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CLTCQ00610 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CLTCQ00610 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
CLTCQ00610 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
CLTCQ00610 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CLTCQ00610 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CLTCQ00610 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CLTCQ00610 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
CLTCQ00610 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms