Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK3Q00526 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK3Q00526 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDK3Q00526 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms