Protein–RNA interactions for Protein: P98196

ATP11A, Probable phospholipid-transporting ATPase IH, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11AP98196 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP11AP98196 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP11AP98196 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP11AP98196 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP11AP98196 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP11AP98196 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP11AP98196 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP11AP98196 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP11AP98196 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP11AP98196 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP11AP98196 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP11AP98196 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP11AP98196 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP11AP98196 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP11AP98196 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP11AP98196 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP11AP98196 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP11AP98196 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP11AP98196 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP11AP98196 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP11AP98196 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP11AP98196 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP11AP98196 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP11AP98196 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP11AP98196 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP11AP98196 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP11AP98196 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP11AP98196 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP11AP98196 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP11AP98196 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms