Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FGD1P98174 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FGD1P98174 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FGD1P98174 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FGD1P98174 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FGD1P98174 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FGD1P98174 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FGD1P98174 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FGD1P98174 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
FGD1P98174 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FGD1P98174 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FGD1P98174 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FGD1P98174 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FGD1P98174 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FGD1P98174 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FGD1P98174 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FGD1P98174 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FGD1P98174 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FGD1P98174 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FGD1P98174 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FGD1P98174 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FGD1P98174 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FGD1P98174 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FGD1P98174 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FGD1P98174 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FGD1P98174 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
FGD1P98174 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FGD1P98174 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FGD1P98174 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FGD1P98174 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FGD1P98174 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FGD1P98174 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FGD1P98174 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FGD1P98174 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FGD1P98174 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FGD1P98174 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FGD1P98174 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FGD1P98174 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FGD1P98174 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FGD1P98174 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FGD1P98174 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FGD1P98174 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FGD1P98174 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FGD1P98174 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FGD1P98174 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FGD1P98174 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FGD1P98174 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FGD1P98174 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FGD1P98174 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FGD1P98174 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FGD1P98174 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FGD1P98174 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
FGD1P98174 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
FGD1P98174 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
FGD1P98174 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FGD1P98174 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FGD1P98174 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FGD1P98174 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FGD1P98174 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FGD1P98174 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FGD1P98174 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FGD1P98174 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FGD1P98174 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FGD1P98174 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FGD1P98174 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FGD1P98174 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FGD1P98174 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FGD1P98174 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FGD1P98174 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FGD1P98174 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FGD1P98174 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FGD1P98174 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FGD1P98174 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FGD1P98174 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FGD1P98174 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FGD1P98174 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FGD1P98174 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FGD1P98174 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FGD1P98174 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FGD1P98174 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FGD1P98174 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FGD1P98174 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FGD1P98174 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FGD1P98174 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FGD1P98174 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FGD1P98174 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FGD1P98174 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FGD1P98174 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
FGD1P98174 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FGD1P98174 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FGD1P98174 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FGD1P98174 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FGD1P98174 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FGD1P98174 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FGD1P98174 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FGD1P98174 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FGD1P98174 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FGD1P98174 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FGD1P98174 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
FGD1P98174 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms