Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms