Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR2FP61218 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR2FP61218 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR2FP61218 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR2FP61218 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR2FP61218 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2FP61218 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2FP61218 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24■■□□□ 1.43
POLR2FP61218 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2FP61218 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24■■□□□ 1.43
POLR2FP61218 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2FP61218 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2FP61218 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2FP61218 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2FP61218 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2FP61218 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2FP61218 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2FP61218 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2FP61218 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2FP61218 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2FP61218 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2FP61218 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2FP61218 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2FP61218 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2FP61218 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2FP61218 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2FP61218 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2FP61218 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2FP61218 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2FP61218 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2FP61218 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2FP61218 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2FP61218 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2FP61218 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2FP61218 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR2FP61218 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR2FP61218 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR2FP61218 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR2FP61218 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR2FP61218 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR2FP61218 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR2FP61218 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR2FP61218 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2FP61218 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2FP61218 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2FP61218 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2FP61218 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2FP61218 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2FP61218 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms