Protein–RNA interactions for Protein: P61201

COPS2, COP9 signalosome complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS2P61201 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPS2P61201 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPS2P61201 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COPS2P61201 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COPS2P61201 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COPS2P61201 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
COPS2P61201 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COPS2P61201 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
COPS2P61201 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COPS2P61201 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
COPS2P61201 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COPS2P61201 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
COPS2P61201 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COPS2P61201 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COPS2P61201 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
COPS2P61201 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COPS2P61201 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COPS2P61201 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COPS2P61201 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPS2P61201 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPS2P61201 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPS2P61201 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPS2P61201 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPS2P61201 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPS2P61201 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPS2P61201 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPS2P61201 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPS2P61201 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
COPS2P61201 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPS2P61201 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPS2P61201 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPS2P61201 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPS2P61201 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPS2P61201 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPS2P61201 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPS2P61201 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
COPS2P61201 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPS2P61201 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPS2P61201 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
COPS2P61201 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPS2P61201 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPS2P61201 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPS2P61201 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
COPS2P61201 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPS2P61201 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPS2P61201 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPS2P61201 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPS2P61201 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPS2P61201 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPS2P61201 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPS2P61201 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPS2P61201 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPS2P61201 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPS2P61201 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
COPS2P61201 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPS2P61201 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPS2P61201 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPS2P61201 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPS2P61201 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS2P61201 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS2P61201 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS2P61201 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS2P61201 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS2P61201 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS2P61201 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS2P61201 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS2P61201 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS2P61201 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS2P61201 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS2P61201 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPS2P61201 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPS2P61201 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPS2P61201 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPS2P61201 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPS2P61201 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPS2P61201 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPS2P61201 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPS2P61201 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPS2P61201 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPS2P61201 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPS2P61201 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPS2P61201 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPS2P61201 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPS2P61201 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPS2P61201 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
COPS2P61201 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
COPS2P61201 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
COPS2P61201 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPS2P61201 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPS2P61201 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPS2P61201 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPS2P61201 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPS2P61201 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPS2P61201 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPS2P61201 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPS2P61201 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPS2P61201 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPS2P61201 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPS2P61201 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPS2P61201 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms