Protein–RNA interactions for Protein: P61019

RAB2A, Ras-related protein Rab-2A, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2AP61019 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB2AP61019 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB2AP61019 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB2AP61019 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB2AP61019 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB2AP61019 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB2AP61019 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB2AP61019 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB2AP61019 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB2AP61019 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB2AP61019 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB2AP61019 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB2AP61019 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB2AP61019 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB2AP61019 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB2AP61019 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB2AP61019 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB2AP61019 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB2AP61019 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB2AP61019 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB2AP61019 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB2AP61019 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB2AP61019 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB2AP61019 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB2AP61019 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB2AP61019 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB2AP61019 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB2AP61019 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB2AP61019 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB2AP61019 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB2AP61019 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB2AP61019 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB2AP61019 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB2AP61019 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB2AP61019 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB2AP61019 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB2AP61019 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB2AP61019 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB2AP61019 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB2AP61019 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB2AP61019 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB2AP61019 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB2AP61019 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB2AP61019 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB2AP61019 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB2AP61019 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB2AP61019 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB2AP61019 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB2AP61019 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms