Protein–RNA interactions for Protein: P55145

MANF, Mesencephalic astrocyte-derived neurotrophic factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MANFP55145 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MANFP55145 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
MANFP55145 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MANFP55145 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MANFP55145 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MANFP55145 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MANFP55145 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MANFP55145 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MANFP55145 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MANFP55145 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MANFP55145 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MANFP55145 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MANFP55145 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MANFP55145 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MANFP55145 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MANFP55145 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MANFP55145 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MANFP55145 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MANFP55145 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MANFP55145 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MANFP55145 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MANFP55145 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MANFP55145 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MANFP55145 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MANFP55145 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MANFP55145 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MANFP55145 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MANFP55145 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MANFP55145 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MANFP55145 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MANFP55145 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MANFP55145 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MANFP55145 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MANFP55145 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MANFP55145 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MANFP55145 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MANFP55145 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MANFP55145 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MANFP55145 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MANFP55145 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MANFP55145 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MANFP55145 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MANFP55145 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
MANFP55145 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MANFP55145 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MANFP55145 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MANFP55145 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MANFP55145 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
MANFP55145 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MANFP55145 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MANFP55145 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MANFP55145 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MANFP55145 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
MANFP55145 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MANFP55145 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
MANFP55145 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MANFP55145 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MANFP55145 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MANFP55145 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MANFP55145 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MANFP55145 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MANFP55145 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MANFP55145 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
MANFP55145 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MANFP55145 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MANFP55145 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MANFP55145 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MANFP55145 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MANFP55145 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MANFP55145 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MANFP55145 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MANFP55145 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MANFP55145 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MANFP55145 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MANFP55145 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
MANFP55145 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
MANFP55145 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
MANFP55145 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
MANFP55145 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
MANFP55145 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MANFP55145 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MANFP55145 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MANFP55145 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MANFP55145 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MANFP55145 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MANFP55145 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MANFP55145 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MANFP55145 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MANFP55145 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MANFP55145 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MANFP55145 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MANFP55145 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MANFP55145 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MANFP55145 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MANFP55145 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MANFP55145 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MANFP55145 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MANFP55145 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MANFP55145 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MANFP55145 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms