Protein–RNA interactions for Protein: P54840

GYS2, Glycogen [starch] synthase, liver, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYS2P54840 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GYS2P54840 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GYS2P54840 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GYS2P54840 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GYS2P54840 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GYS2P54840 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GYS2P54840 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GYS2P54840 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GYS2P54840 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GYS2P54840 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GYS2P54840 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GYS2P54840 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GYS2P54840 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GYS2P54840 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GYS2P54840 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GYS2P54840 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GYS2P54840 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GYS2P54840 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GYS2P54840 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GYS2P54840 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GYS2P54840 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GYS2P54840 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GYS2P54840 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GYS2P54840 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GYS2P54840 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GYS2P54840 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GYS2P54840 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GYS2P54840 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GYS2P54840 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GYS2P54840 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GYS2P54840 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GYS2P54840 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GYS2P54840 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GYS2P54840 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GYS2P54840 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GYS2P54840 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GYS2P54840 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GYS2P54840 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GYS2P54840 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GYS2P54840 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GYS2P54840 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GYS2P54840 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GYS2P54840 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GYS2P54840 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GYS2P54840 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GYS2P54840 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GYS2P54840 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GYS2P54840 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GYS2P54840 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GYS2P54840 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GYS2P54840 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GYS2P54840 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GYS2P54840 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GYS2P54840 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GYS2P54840 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GYS2P54840 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GYS2P54840 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GYS2P54840 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GYS2P54840 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GYS2P54840 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GYS2P54840 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GYS2P54840 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GYS2P54840 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GYS2P54840 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GYS2P54840 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GYS2P54840 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GYS2P54840 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GYS2P54840 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GYS2P54840 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GYS2P54840 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GYS2P54840 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GYS2P54840 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GYS2P54840 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GYS2P54840 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GYS2P54840 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GYS2P54840 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GYS2P54840 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GYS2P54840 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GYS2P54840 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GYS2P54840 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GYS2P54840 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GYS2P54840 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GYS2P54840 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GYS2P54840 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GYS2P54840 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GYS2P54840 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GYS2P54840 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GYS2P54840 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GYS2P54840 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GYS2P54840 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GYS2P54840 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GYS2P54840 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GYS2P54840 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GYS2P54840 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GYS2P54840 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GYS2P54840 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GYS2P54840 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GYS2P54840 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GYS2P54840 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GYS2P54840 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms