Protein–RNA interactions for Protein: P54821

PRRX1, Paired mesoderm homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1P54821 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRRX1P54821 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRRX1P54821 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRRX1P54821 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRRX1P54821 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRRX1P54821 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRRX1P54821 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRRX1P54821 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PRRX1P54821 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRRX1P54821 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRRX1P54821 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRRX1P54821 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRRX1P54821 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRRX1P54821 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRRX1P54821 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRRX1P54821 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRRX1P54821 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRRX1P54821 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRRX1P54821 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRRX1P54821 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRRX1P54821 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRRX1P54821 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRRX1P54821 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRRX1P54821 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRRX1P54821 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRRX1P54821 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRRX1P54821 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRRX1P54821 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PRRX1P54821 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRRX1P54821 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRRX1P54821 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRRX1P54821 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRRX1P54821 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRRX1P54821 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PRRX1P54821 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRRX1P54821 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRRX1P54821 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRRX1P54821 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRRX1P54821 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRRX1P54821 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRRX1P54821 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRRX1P54821 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRRX1P54821 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRRX1P54821 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRRX1P54821 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRRX1P54821 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRRX1P54821 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRRX1P54821 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRRX1P54821 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRRX1P54821 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRRX1P54821 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRRX1P54821 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRRX1P54821 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRRX1P54821 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRRX1P54821 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRRX1P54821 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRRX1P54821 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRRX1P54821 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PRRX1P54821 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRRX1P54821 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PRRX1P54821 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRRX1P54821 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRRX1P54821 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRRX1P54821 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRRX1P54821 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PRRX1P54821 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRRX1P54821 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRRX1P54821 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRRX1P54821 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRRX1P54821 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRRX1P54821 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRRX1P54821 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRRX1P54821 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRRX1P54821 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRRX1P54821 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRRX1P54821 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRRX1P54821 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRRX1P54821 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRRX1P54821 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PRRX1P54821 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRRX1P54821 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRRX1P54821 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRRX1P54821 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRRX1P54821 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRRX1P54821 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRRX1P54821 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRRX1P54821 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRRX1P54821 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRRX1P54821 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRRX1P54821 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRRX1P54821 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRRX1P54821 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRRX1P54821 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRRX1P54821 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRRX1P54821 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRRX1P54821 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRRX1P54821 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRRX1P54821 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRRX1P54821 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRRX1P54821 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms