Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGGT1BP53609 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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