Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
SMARCA4P51532 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
SMARCA4P51532 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
SMARCA4P51532 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC40.57■■■■■ 4.09
SMARCA4P51532 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.09
SMARCA4P51532 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
SMARCA4P51532 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
SMARCA4P51532 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
SMARCA4P51532 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
SMARCA4P51532 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
SMARCA4P51532 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
SMARCA4P51532 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
SMARCA4P51532 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC40.56■■■■■ 4.08
SMARCA4P51532 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC40.56■■■■■ 4.08
SMARCA4P51532 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
SMARCA4P51532 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC40.55■■■■■ 4.08
SMARCA4P51532 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
SMARCA4P51532 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC40.55■■■■■ 4.08
SMARCA4P51532 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.55■■■■■ 4.08
SMARCA4P51532 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
SMARCA4P51532 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
SMARCA4P51532 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC40.55■■■■■ 4.08
SMARCA4P51532 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
SMARCA4P51532 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
SMARCA4P51532 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
SMARCA4P51532 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
SMARCA4P51532 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
SMARCA4P51532 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
SMARCA4P51532 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
SMARCA4P51532 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
SMARCA4P51532 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
SMARCA4P51532 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
SMARCA4P51532 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
SMARCA4P51532 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
SMARCA4P51532 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
SMARCA4P51532 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
SMARCA4P51532 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
SMARCA4P51532 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
SMARCA4P51532 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
SMARCA4P51532 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
SMARCA4P51532 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
SMARCA4P51532 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
SMARCA4P51532 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
SMARCA4P51532 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
SMARCA4P51532 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
SMARCA4P51532 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
SMARCA4P51532 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
SMARCA4P51532 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
SMARCA4P51532 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
SMARCA4P51532 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
SMARCA4P51532 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
SMARCA4P51532 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC40.5■■■■■ 4.07
SMARCA4P51532 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC40.49■■■■■ 4.07
SMARCA4P51532 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
SMARCA4P51532 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
SMARCA4P51532 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC40.49■■■■■ 4.07
SMARCA4P51532 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC40.49■■■■■ 4.07
SMARCA4P51532 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC40.49■■■■■ 4.07
SMARCA4P51532 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
SMARCA4P51532 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC40.49■■■■■ 4.07
SMARCA4P51532 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
SMARCA4P51532 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
SMARCA4P51532 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
SMARCA4P51532 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
SMARCA4P51532 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
SMARCA4P51532 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
SMARCA4P51532 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
SMARCA4P51532 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
SMARCA4P51532 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
SMARCA4P51532 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC40.47■■■■■ 4.07
SMARCA4P51532 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
SMARCA4P51532 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC40.46■■■■■ 4.07
SMARCA4P51532 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
SMARCA4P51532 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
SMARCA4P51532 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
SMARCA4P51532 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC40.45■■■■■ 4.07
SMARCA4P51532 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC40.45■■■■■ 4.07
SMARCA4P51532 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
SMARCA4P51532 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
SMARCA4P51532 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
SMARCA4P51532 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
SMARCA4P51532 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
SMARCA4P51532 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
SMARCA4P51532 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
SMARCA4P51532 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
SMARCA4P51532 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
SMARCA4P51532 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
SMARCA4P51532 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
SMARCA4P51532 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
SMARCA4P51532 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
SMARCA4P51532 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
SMARCA4P51532 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
SMARCA4P51532 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC40.43■■■■■ 4.06
SMARCA4P51532 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC40.43■■■■■ 4.06
SMARCA4P51532 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
SMARCA4P51532 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
SMARCA4P51532 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
SMARCA4P51532 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
SMARCA4P51532 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
SMARCA4P51532 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms