Protein–RNA interactions for Protein: P49815

TSC2, Tuberin, humanhuman

Predictions only

Length 1,807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2P49815 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TSC2P49815 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSC2P49815 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSC2P49815 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSC2P49815 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSC2P49815 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSC2P49815 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSC2P49815 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSC2P49815 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSC2P49815 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSC2P49815 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSC2P49815 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSC2P49815 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSC2P49815 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSC2P49815 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSC2P49815 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSC2P49815 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSC2P49815 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSC2P49815 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSC2P49815 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSC2P49815 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSC2P49815 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSC2P49815 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSC2P49815 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSC2P49815 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TSC2P49815 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSC2P49815 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSC2P49815 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSC2P49815 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSC2P49815 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSC2P49815 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TSC2P49815 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TSC2P49815 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSC2P49815 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSC2P49815 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSC2P49815 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TSC2P49815 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TSC2P49815 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TSC2P49815 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TSC2P49815 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TSC2P49815 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TSC2P49815 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TSC2P49815 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSC2P49815 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSC2P49815 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSC2P49815 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSC2P49815 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSC2P49815 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TSC2P49815 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSC2P49815 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSC2P49815 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSC2P49815 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSC2P49815 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TSC2P49815 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSC2P49815 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSC2P49815 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSC2P49815 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSC2P49815 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSC2P49815 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSC2P49815 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSC2P49815 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSC2P49815 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TSC2P49815 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSC2P49815 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSC2P49815 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSC2P49815 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSC2P49815 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSC2P49815 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSC2P49815 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSC2P49815 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSC2P49815 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSC2P49815 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSC2P49815 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSC2P49815 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSC2P49815 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSC2P49815 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSC2P49815 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSC2P49815 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSC2P49815 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSC2P49815 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSC2P49815 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSC2P49815 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSC2P49815 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSC2P49815 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSC2P49815 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSC2P49815 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSC2P49815 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSC2P49815 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSC2P49815 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSC2P49815 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSC2P49815 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSC2P49815 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSC2P49815 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSC2P49815 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSC2P49815 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TSC2P49815 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSC2P49815 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TSC2P49815 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TSC2P49815 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSC2P49815 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms