Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRIM1P49642 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRIM1P49642 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRIM1P49642 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRIM1P49642 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRIM1P49642 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRIM1P49642 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRIM1P49642 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRIM1P49642 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRIM1P49642 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRIM1P49642 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRIM1P49642 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRIM1P49642 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRIM1P49642 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRIM1P49642 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRIM1P49642 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRIM1P49642 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRIM1P49642 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRIM1P49642 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRIM1P49642 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRIM1P49642 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRIM1P49642 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRIM1P49642 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRIM1P49642 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PRIM1P49642 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRIM1P49642 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRIM1P49642 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PRIM1P49642 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRIM1P49642 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRIM1P49642 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRIM1P49642 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRIM1P49642 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRIM1P49642 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRIM1P49642 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRIM1P49642 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRIM1P49642 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRIM1P49642 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRIM1P49642 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms