Protein–RNA interactions for Protein: P49223

SPINT3, Kunitz-type protease inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINT3P49223 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPINT3P49223 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPINT3P49223 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPINT3P49223 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPINT3P49223 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPINT3P49223 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SPINT3P49223 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPINT3P49223 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPINT3P49223 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SPINT3P49223 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SPINT3P49223 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPINT3P49223 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPINT3P49223 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPINT3P49223 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPINT3P49223 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPINT3P49223 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPINT3P49223 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPINT3P49223 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms