Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NRIP1P48552 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms