Protein–RNA interactions for Protein: P47972

NPTX2, Neuronal pentraxin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX2P47972 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPTX2P47972 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPTX2P47972 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPTX2P47972 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPTX2P47972 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPTX2P47972 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPTX2P47972 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPTX2P47972 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPTX2P47972 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPTX2P47972 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPTX2P47972 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPTX2P47972 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPTX2P47972 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPTX2P47972 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPTX2P47972 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPTX2P47972 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPTX2P47972 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPTX2P47972 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPTX2P47972 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NPTX2P47972 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPTX2P47972 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPTX2P47972 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NPTX2P47972 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPTX2P47972 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPTX2P47972 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPTX2P47972 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NPTX2P47972 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NPTX2P47972 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPTX2P47972 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPTX2P47972 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPTX2P47972 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPTX2P47972 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPTX2P47972 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NPTX2P47972 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPTX2P47972 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPTX2P47972 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms