Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEDD4P46934 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms