Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RECQLP46063 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RECQLP46063 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RECQLP46063 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RECQLP46063 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RECQLP46063 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RECQLP46063 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RECQLP46063 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RECQLP46063 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RECQLP46063 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RECQLP46063 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RECQLP46063 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RECQLP46063 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RECQLP46063 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RECQLP46063 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RECQLP46063 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RECQLP46063 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RECQLP46063 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RECQLP46063 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RECQLP46063 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RECQLP46063 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RECQLP46063 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RECQLP46063 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RECQLP46063 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RECQLP46063 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RECQLP46063 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RECQLP46063 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RECQLP46063 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RECQLP46063 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RECQLP46063 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RECQLP46063 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RECQLP46063 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RECQLP46063 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RECQLP46063 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RECQLP46063 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RECQLP46063 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RECQLP46063 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RECQLP46063 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RECQLP46063 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RECQLP46063 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RECQLP46063 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RECQLP46063 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RECQLP46063 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RECQLP46063 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RECQLP46063 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RECQLP46063 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RECQLP46063 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RECQLP46063 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RECQLP46063 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RECQLP46063 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RECQLP46063 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RECQLP46063 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RECQLP46063 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RECQLP46063 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RECQLP46063 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RECQLP46063 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RECQLP46063 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RECQLP46063 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RECQLP46063 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RECQLP46063 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RECQLP46063 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RECQLP46063 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RECQLP46063 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RECQLP46063 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RECQLP46063 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RECQLP46063 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RECQLP46063 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RECQLP46063 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RECQLP46063 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RECQLP46063 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RECQLP46063 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RECQLP46063 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RECQLP46063 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RECQLP46063 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RECQLP46063 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RECQLP46063 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RECQLP46063 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RECQLP46063 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RECQLP46063 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RECQLP46063 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RECQLP46063 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RECQLP46063 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RECQLP46063 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RECQLP46063 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RECQLP46063 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RECQLP46063 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RECQLP46063 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RECQLP46063 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RECQLP46063 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RECQLP46063 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RECQLP46063 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RECQLP46063 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RECQLP46063 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RECQLP46063 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RECQLP46063 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RECQLP46063 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RECQLP46063 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RECQLP46063 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RECQLP46063 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RECQLP46063 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms