Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms